Colloque proposé par le réseau OuestOÏD Le 04 avril 2024 [...]
« Ainsi, nous aimerions définir un organoïde comme contenant plusieurs types de cellules qui se développent à partir de cellules souches ou de géniteurs d'organes et s'auto-organisent par le biais du tri cellulaire et de l'engagement de la lignée spatialement restreint, similaire au processus in vivo » (Lancaster et Knoblich, 2014). #biologie #3DComplexes
C’est avec l’idée de fédérer la communauté scientifique et de décloisonner les ressources, qu’est né le hackathon MoDaL. Cet événement, qui s'est déroulé en ligne le 25 janvier et le 1er février, s’est voulu un moment d’échange et de travail collaboratif. Pendant le hackathon le mot clé a été collaboration : des projets aux exposés, le programme s’est construit avec la contribution des participants qui restent, pendant toute la durée de l'événement, protagonistes et animateurs.
Le GIS Biogenouest ouvre un appel à manifestation d'intérêt à toute la communauté scientifique du Grand Ouest. Un projet fédérateur a un caractère transversal, innovant, original et « différenciant ». Il met en avant les compétences et les atouts régionaux.
Le projet fédérateur MoDaL (Multi-Scale Data Links), porté par le réseau Biogenouest, vise à décloisonner les ressources et à promouvoir les moments d’échange et de travail collaboratif autour de l'intégration des données biologiques multi-échelles.
[Multi-scale Data Links] Organiser un hackathon autour de l'intégration des données hétérogènes (phénotypage et génotypage) et/ou multi-échelles (gènes, cellules, organes, individus, population).
Que ce soient des données de génomique, d’imagerie in vitro ou in vivo, de modèles animaux ou végétaux, les données en sciences de la vie sont aujourd’hui pour la plupart traitées “en silos”. Le projet fédérateur MoDaL (Multi-Scale Data Links), porté par le réseau Biogenouest, vise à décloisonner les ressources et à promouvoir les moments d’échange et de travail collaboratif autour de l'intégration des données biologiques multi-échelle. Le but de ces rencontres est de découvrir la diversité des profils de la recherche en biologie et en santé dans le grand ouest. J’ai rencontré Perrine Paul-Gilloteaux pour les rencontres Modal le 10 juillet 2020 dans les locaux de l’équipe UMR_S 1087/UMR_C 6291 de l'Unité de Recherche de l'Institut du Thorax, à Nantes.
L’une des problématiques actuelles majeures de la biologie consiste à homogénéiser les formats et structures de données afin de pouvoir les analyser ensemble, et non « en silo ».
L’originalité de ce projet interrégional Bretagne et Pays de la Loire est d’associer 9 plates-formes impliquées dans plusieurs axes du réseau Biogenouest (Exploration fonctionnelle, Protéomique, Analyse structurale et métabolomique, Bio-informatique) autour d’une source de biomolécules innovantes : les micromycètes marins.
L'une des problématiques actuelles majeures de la biologie consiste à homogénéiser les formats et structures de données afin de pouvoir les analyser ensemble, et non "en silo". Sofia Strubbia intervient pour animer cette problématique à l'échelle du réseau Grand Ouest, c'est-à-dire permettre de mettre en relation les différents acteurs du domaine, communiquer sur les projets en cours, et présenter un prototype sur un cas concret : le jeu de données de l'étude ICAN.