Journée d’animation proposée par l’axe Analyse structurale et métabolomique de Biogenouest le 25 novembre 2024 à Rennes sur le thème « Traitements des données : du signal à l’intégration de données hétérogènes »
📍Pôle Numérique Rennes Beaulieu – 263 Avenue du Général Leclerc – 35700 Rennes
La journée, ouverte à toute la communauté Biogenouest, se déroulera en présentiel sur le campus de Beaulieu à Rennes le lundi 25 novembre 2024 de 9h à 16h30. Elle vise à explorer les avancées, défis et opportunités dans le domaine du traitement et l’analyse des données, en mettant particulièrement l’accent sur leur validation, l’obtention de clés d’interprétation, et l’intégration de données provenant de diverses sources, telles que celles issues de la spectrométrie de masse, la RMN, la chromatographie, les approches dites « omiques » et l’imagerie.
✏️ Inscription
« Traitement des données :
du signal à l’intégration de données hétérogènes »
Ouvert à toutes et à tous, sur inscription (avant le 15 novembre 2024)
9:00 Accueil Café
9:30 – Introduction de la journée
Session Traitement du signal
10:00 « Analyses de compositions isotopiques d’acide gras par GC-c-IRMS : problèmes rencontrés lors du traitement du signal, réflexions et pistes d‘améliorations. » par Loïc Harrault, Rudolph Corvaisier, Fabienne Le Grand et Philippe Soudant, LIPIDOCEAN, Brest
10:20 « Développements algorithmiques pour le traitement d’images 3D de grande volumétrie » par David Legland, BIBS, Nantes
10:40 « Couplage GSMNs et profilages métaboliques pour la reconstruction de voies de biosynthèse » par Gabriel Markov, LBI2M, Roscoff
Session Visualisation des données
11:00 « XploreMzSpectra : un outil pour explorer les ressemblances d’une collection de spectres de masse » par Virginie Lollier, BIBS, Nantes
11:20 « ODAM: Open Data for Access and Mining” par Daniel Jacob, BIBS, Nantes
11:40 « Identification et quantification automatique de métabolites dans des spectres RMN » par Rémi Servien, Laboratoire de Biotechnologie de l’Environnement, Narbonne
12:10 Pause déjeuner
Session Intégration de données hétérogènes
14:00 « La métabolomique : une mine d’or de données nécessitant une collaboration renforcée entre chimistes et bioinformaticiens » par Yann Guitton, Corsaire-Melisa, Nantes
14:20 « Outils bio-informatiques et méthodologie pour l’interprétation des données transcriptomiques et leur intégration aux données métabolomiques » par Mathieu Rouel, UMR_S1064 Center for Research in transplantation and Translational Immunology, Nantes
14:40 « Couplage de la métabolomique non ciblée et du métabarcoding : une approche d’intérêt pour l’étude des interactions symbiotiques marines » par Samuel Orgeas-Gobin, MNHN et AD2M, Roscoff
15:00 Pause café/thé
15:30 : « Métabolomique et intégration de données : application à l’étude transversale SAFIR » par Chloé Cloteau, Corsaire-M.shark, Nantes
15:50 « L’intégration multi-bloc de différents jeux de données de RMN métabolomique pour répondre à diverses questions : de l’intérêt technologique à l’intérêt clinique » par Marine Letertre, Corsaire-RMN CEISAM, Nantes
16:10 « Diversité phytochimique de collections génétiques de Brassicacées pour la recherche de caractères d’intérêts agronomiques et agroécologiques » par Pauline Le Boulch, Corsaire-P2M2, Rennes
16:30 Clôture de la journée
